Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Cldn13Q9Z0S4 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Cldn13Q9Z0S4 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cldn13Q9Z0S4 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cldn13Q9Z0S4 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cldn13Q9Z0S4 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cldn13Q9Z0S4 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cldn13Q9Z0S4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cldn13Q9Z0S4 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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