Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU78

Pdcd6ip, Programmed cell death 6-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6ipQ9WU78 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd6ipQ9WU78 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms