Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms