Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms