Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms