Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Trim44Q9QXA7 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Trim44Q9QXA7 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Trim44Q9QXA7 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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