Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Trpc5Q9QX29 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trpc5Q9QX29 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Trpc5Q9QX29 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trpc5Q9QX29 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trpc5Q9QX29 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Trpc5Q9QX29 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Trpc5Q9QX29 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpc5Q9QX29 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpc5Q9QX29 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpc5Q9QX29 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Trpc5Q9QX29 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Trpc5Q9QX29 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc5Q9QX29 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc5Q9QX29 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc5Q9QX29 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc5Q9QX29 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc5Q9QX29 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc5Q9QX29 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc5Q9QX29 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc5Q9QX29 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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