Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms