Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Cacna1fQ9JIS7 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Cacna1fQ9JIS7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1fQ9JIS7 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1fQ9JIS7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1fQ9JIS7 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1fQ9JIS7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1fQ9JIS7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1fQ9JIS7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1fQ9JIS7 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1fQ9JIS7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1fQ9JIS7 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1fQ9JIS7 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1fQ9JIS7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1fQ9JIS7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1fQ9JIS7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1fQ9JIS7 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1fQ9JIS7 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1fQ9JIS7 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1fQ9JIS7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1fQ9JIS7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1fQ9JIS7 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacna1fQ9JIS7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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