Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 59 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Smco4Q9JIS3 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Smco4Q9JIS3 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Smco4Q9JIS3 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Smco4Q9JIS3 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Smco4Q9JIS3 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Smco4Q9JIS3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smco4Q9JIS3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smco4Q9JIS3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smco4Q9JIS3 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smco4Q9JIS3 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smco4Q9JIS3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Smco4Q9JIS3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smco4Q9JIS3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smco4Q9JIS3 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smco4Q9JIS3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smco4Q9JIS3 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smco4Q9JIS3 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smco4Q9JIS3 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smco4Q9JIS3 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Smco4Q9JIS3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Smco4Q9JIS3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smco4Q9JIS3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smco4Q9JIS3 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smco4Q9JIS3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smco4Q9JIS3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smco4Q9JIS3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smco4Q9JIS3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smco4Q9JIS3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smco4Q9JIS3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Smco4Q9JIS3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smco4Q9JIS3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smco4Q9JIS3 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Smco4Q9JIS3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smco4Q9JIS3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smco4Q9JIS3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Smco4Q9JIS3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smco4Q9JIS3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smco4Q9JIS3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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