Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
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