Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms