Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Usp29Q9ES63 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Usp29Q9ES63 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Usp29Q9ES63 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
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