Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tfcp2Q9ERA0 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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