Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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Rnf6Q9DBU5 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Rnf6Q9DBU5 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Rnf6Q9DBU5 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Rnf6Q9DBU5 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Rnf6Q9DBU5 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Rnf6Q9DBU5 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Rnf6Q9DBU5 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Rnf6Q9DBU5 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Rnf6Q9DBU5 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Rnf6Q9DBU5 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Rnf6Q9DBU5 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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