Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 584 ms