Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms