Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Smco2Q9DA21 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco2Q9DA21 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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