Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Pdzd9Q9D9M4 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Pdzd9Q9D9M4 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Pdzd9Q9D9M4 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Pdzd9Q9D9M4 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Pdzd9Q9D9M4 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Pdzd9Q9D9M4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Pdzd9Q9D9M4 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Pdzd9Q9D9M4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Pdzd9Q9D9M4 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Pdzd9Q9D9M4 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Pdzd9Q9D9M4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Pdzd9Q9D9M4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms