Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms