Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SlirpQ9D8T7 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms