Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms