Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms