Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I0

Rtl8c, Cxx1c protein, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8cQ9D6I0 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rtl8cQ9D6I0 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms