Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms