Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms