Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms