Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trmt44Q9D2Q2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt44Q9D2Q2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Trmt44Q9D2Q2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Trmt44Q9D2Q2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Trmt44Q9D2Q2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt44Q9D2Q2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt44Q9D2Q2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt44Q9D2Q2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Trmt44Q9D2Q2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt44Q9D2Q2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt44Q9D2Q2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt44Q9D2Q2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt44Q9D2Q2 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt44Q9D2Q2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt44Q9D2Q2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt44Q9D2Q2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt44Q9D2Q2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt44Q9D2Q2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt44Q9D2Q2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt44Q9D2Q2 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt44Q9D2Q2 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt44Q9D2Q2 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms