Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Zbed3Q9D0L1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Zbed3Q9D0L1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Zbed3Q9D0L1 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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