Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Rfc5Q9D0F6 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Rfc5Q9D0F6 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Rfc5Q9D0F6 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Rfc5Q9D0F6 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Rfc5Q9D0F6 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Rfc5Q9D0F6 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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