Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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