Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYC3

Tmem39a, Transmembrane protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39aQ9CYC3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem39aQ9CYC3 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem39aQ9CYC3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39aQ9CYC3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39aQ9CYC3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39aQ9CYC3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39aQ9CYC3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39aQ9CYC3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39aQ9CYC3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39aQ9CYC3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39aQ9CYC3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39aQ9CYC3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39aQ9CYC3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39aQ9CYC3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39aQ9CYC3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39aQ9CYC3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39aQ9CYC3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39aQ9CYC3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39aQ9CYC3 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39aQ9CYC3 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39aQ9CYC3 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39aQ9CYC3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39aQ9CYC3 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39aQ9CYC3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39aQ9CYC3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39aQ9CYC3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39aQ9CYC3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39aQ9CYC3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39aQ9CYC3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39aQ9CYC3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39aQ9CYC3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39aQ9CYC3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39aQ9CYC3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39aQ9CYC3 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39aQ9CYC3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39aQ9CYC3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39aQ9CYC3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms