Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gins3Q9CY94 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gins3Q9CY94 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gins3Q9CY94 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gins3Q9CY94 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gins3Q9CY94 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gins3Q9CY94 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gins3Q9CY94 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gins3Q9CY94 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gins3Q9CY94 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gins3Q9CY94 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gins3Q9CY94 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gins3Q9CY94 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gins3Q9CY94 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gins3Q9CY94 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gins3Q9CY94 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gins3Q9CY94 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gins3Q9CY94 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gins3Q9CY94 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gins3Q9CY94 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gins3Q9CY94 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gins3Q9CY94 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gins3Q9CY94 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gins3Q9CY94 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gins3Q9CY94 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gins3Q9CY94 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gins3Q9CY94 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gins3Q9CY94 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gins3Q9CY94 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gins3Q9CY94 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gins3Q9CY94 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gins3Q9CY94 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gins3Q9CY94 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gins3Q9CY94 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms