Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Xrcc3Q9CXE6 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Xrcc3Q9CXE6 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Xrcc3Q9CXE6 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Xrcc3Q9CXE6 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Xrcc3Q9CXE6 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Xrcc3Q9CXE6 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Xrcc3Q9CXE6 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Xrcc3Q9CXE6 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Xrcc3Q9CXE6 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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Xrcc3Q9CXE6 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms