Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms