Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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