Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms