Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ndufb9Q9CQJ8 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ndufb9Q9CQJ8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ndufb9Q9CQJ8 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ndufb9Q9CQJ8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ndufb9Q9CQJ8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ndufb9Q9CQJ8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ndufb9Q9CQJ8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufb9Q9CQJ8 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms