Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl11Q9CQF0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms