Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Chmp3Q9CQ10 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Chmp3Q9CQ10 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Chmp3Q9CQ10 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Chmp3Q9CQ10 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Chmp3Q9CQ10 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Chmp3Q9CQ10 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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Chmp3Q9CQ10 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Chmp3Q9CQ10 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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