Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms