Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a6cQ99N08 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ms4a6cQ99N08 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ms4a6cQ99N08 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Ms4a6cQ99N08 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Ms4a6cQ99N08 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ms4a6cQ99N08 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ms4a6cQ99N08 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ms4a6cQ99N08 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ms4a6cQ99N08 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms