Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms