Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms