Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms