Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Ddb2Q99J79 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Ddb2Q99J79 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Ddb2Q99J79 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Ddb2Q99J79 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Ddb2Q99J79 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Ddb2Q99J79 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Ddb2Q99J79 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Ddb2Q99J79 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Ddb2Q99J79 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Ddb2Q99J79 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ddb2Q99J79 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
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Ddb2Q99J79 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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