Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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