Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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