Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3b3Q921M3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b3Q921M3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b3Q921M3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b3Q921M3 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b3Q921M3 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b3Q921M3 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b3Q921M3 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b3Q921M3 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b3Q921M3 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b3Q921M3 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b3Q921M3 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b3Q921M3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b3Q921M3 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b3Q921M3 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b3Q921M3 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b3Q921M3 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b3Q921M3 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms