Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms